從分子蒸餾技術以上的特點可知,它在實際工業化的應用中比常規蒸餾技術具有以下明顯的優勢：
1、對于高沸點、熱敏及易氧化物料的分離，分子蒸餾提供了分離方法。因為分子蒸餾在遠低于物料沸點的溫度下操作，而且物料停留時間短；
2、分子蒸餾可極有效地脫除液體中的物質如有機溶劑、臭味等,這對于采用溶劑萃取后液體的脫溶是非常有效的方法；
3、分子蒸餾可有選擇地蒸出目的產物，去除其它雜質，通過多級分離可同時分離2種以上的物質；
4、分子蒸餾的分餾過程是物理過程，因而可很好地保護被分離物質不受污染和侵害。
分子蒸餾亦稱短程蒸餾，它是一項較新的尚未廣泛應用于工業化生產的液-液分離技術，其應用能解決大量常規蒸餾技術所不能解決的問題。
一套完整的分子蒸餾設備主要包括：分子蒸發器、脫氣系統、進料系統、加熱系統、冷卻真空系統和控制系統。分子蒸餾裝置的核心部分是分子蒸發器，其種類主要有3種：（1）降膜式：為早期形式，結構簡單，但由于液膜厚，效率差，當今世界各國很少采用；（2）刮膜式:形成的液膜薄，分離效率高，但較降膜式結構復雜；（3）離心式：離心力成膜，膜薄，蒸發效率高，但結構復雜，真空密封較難，設備的制造成本高。為提高分離效率，往往需要采用多級串聯使用而實現不同物質的多級分離。